微喷头的分类与结构特点直接关系到喷洒质量和整个系统运行是否可靠，目前微喷头的结构形式有射流式、离心式、折射式和缝隙式四种，但常用的是射流式微喷头和折射式喷头。
射流式微喷头在喷水时不停地旋转，也称为旋转式微喷头。一般由接头、支架喷嘴和折射臂等几个零部件组成。射流式微喷头结构简单，有效湿润半径较大，喷水强度较低，水滴细小，喷灌效果较好。
折射式微喷头没有旋转部件，也称其为固定式微喷头。它是由喷嘴将水流垂直向上喷射到折射锥上使水流被击散成薄水层向四周射出，并形成细小喷洒水滴的喷洒器。
微喷头的工作压力一般为50~2000千帕，喷嘴直径为0.8~2.2毫米，喷水量一般小于240升/小时。选用微喷头时需综合考虑作物种类、种植间距、土壤质地等因素，使微喷系统的灌水强度不大于土壤入渗能力，不造成地面积水。
微灌系统的布置同样有正方形、矩形、三角形等布置形式，具体视种植作物种类、密度等而定。