屠宰加工厂的总体布局应符合卫生要求和科学管理原则，各个车间既相互连贯又合理布局，做到病健隔离、病健分宰，原料、成品、副产品和废弃物的运转不交叉相遇，以免造成污染。

应以绿化带或围墙整个屠宰场的建筑群划分为5个区域：
1、宰前管理区
包括屠羊卸载台、检疫栏、宰前预检分类圈、隔离圈、健羊圈、兽医室等，有条件的单位应设置运输车辆的消毒清洗场所。
2、屠宰加工区
包括屠宰加工车间、内脏整理车间、肉制品加工车间、冷藏库、生化制药及副产品综合利用车间、兽医办公室及化验室。
3、病羊隔离区
包括隔离圈、急宰间、化制间、兽医室以及污水处理设施。
4、行政生活区
包括办公室、车库、库房、食堂和宿舍等。
5、动力区
包括锅炉房、压缩车间、供暖、供热、供气以及制冷等设备。
以上各区之间要明确分区标志，尤其是宰前管理区、生产区和病羊隔离区，要用围墙隔离，设立专门通道相连，并有严密的消毒措施。生活区和生产间要有相当的距离，肉制品、制药、炼油等食用生产间应远离饲养区。病羊隔离圈、急宰间、化制间及污水处理应在生产加工区的下风点。锅炉房应临近食用蒸汽动力车间及浴室附件，距食堂也不易太远。
厂内垃圾、粪便废弃物的集存场所的地面围墙都要便于冲洗消毒。运送垃圾等废弃物的车辆必须是密封不渗水的，这些车辆应配备清洗消毒设施及存放场所。
厂区之间人员的交往，活羊、成品及废弃物的运转，应分设专用的通道，成品与活羊的装卸站台也要分开，以减少污染的机会，所有出入口应设消毒池。
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