今天出去玩了,和大家的讨论都是手机打的零零碎碎的,而且这个楼是我边整理数据边写的,逻辑和思路都很混乱,后面也发现了很多错误。给大家理解带来了困难,现在我把思路整理重新写一下,好久没写论文了,痛苦。
我所采用的资料主要是2017 年圈养大熊猫繁殖管理策略建议及种群概况,简称17概况书,说建议书有些朋友错理解为我使用的数据都是17年的建议配对,不是实际发生过的,事实上,【重点】概况书所有的MK和建议都是基于使用了16年11月中国动物园协会的大熊猫谱系,该谱系简称为16官方谱系。因此我们可以通过MK倒推16官方谱系的父本,这就是我做的讨论内容【重点】。16官方谱系中父本已DNA鉴定或者说分子遗传分析确认过的个体【重点】并没有【重点】在概况书中公布出来,所以讨论的是这些已DNA鉴定个体的父本。但未确认过的个体17概况书都会公布官方谱系中包含的所有父本,以及这些父本的方式(本交NM或人工AI)。表头详见下图

其中谱系号455个体为琳琳,可能父本为盼盼与新兴,事实上大家都知道盼盼基因强大,家族多名后代外貌都有强烈的特征,连第五代天宝依然长得很像他。而琳琳后代并没有出现盼式长相。因此几乎可以确认琳琳父亲是新兴。
但MK值计算依然使用盼盼新兴各一半,盼盼家族庞大,因此琳琳后代MK可能比实际上高很多。
近年来基地新生个体在16官方谱系中仍然父本未确认的有成就萌兰晶奥晶运启启点点毛豆毛桃星辉星繁,因此,我的推算并不包括他们,他们的可能的父本见下图。

16官方谱系未确认不代表现在没确认,也并不代表猫粉认为的父亲错了,只是17概况书用的一个便于整体计算的假设。
比如成就和乔乔长相一样,我们可以确认成就的父亲,但因为未做最后的DNA,17概况书里他的MK值还是用乔乔龙龙各50%进行计算。萌兰也是一样,我们可以确认父亲为美兰,但不能否认官方谱系记录了萌萌和福福人工过,他的MK值福福提供了很微小的一部分。wb某个人说我妖言惑众说么么儿爸爸不是大姐,别有用心,我是不认的,这是官方谱系记录的,当然可能基地16年11月后给么么儿确认了父亲。如果骂我乱说文文父亲是美兰我认,毕竟是我自己推算的数据,而且我也不觉得文文爸爸是美兰。
便于大家看,我把这几只的猫的谱系转化为呼名,呼名资料来自吧友
@行走边 的整理,见下图。除了萌兰,美兰福福分别为0.98,0.02,其他双父本权重一样,各50%。底色越深,代表MK越高,年纪越大。

【】下面是我的推算过程【】
MK即平均亲缘值,是某个个体和整个种群其他个体亲缘值的平均,比如某个种群有A-E五个个体,A与BCDE的亲缘值分别是0.1、0.2、0.3、0.4,那么他的MK就是平均值0.25。
由定义可以知道,某只熊猫的MK值必然和其直系上下两代亲属MK值有关,即父母和子女。有朋友提出MK也要考虑到父母的兄弟姐妹,兄弟姐妹,兄弟姐妹的孩子,孩子的孩子,孩子的其他异父异母兄弟姐妹,这些直系三代以外和旁系亲属所带来的亲缘值,其实已经反应在父母和子女MK上了,所以我们的近似推算不予考虑。父母对该个体的MK影响权重应该是一致的,而子女和父母的权重,以及各子女的权重,比较复杂,需要进一步做数据处理分析。因此本推算只使用于暂时没有后代的个体,讨论个体MK与父母MK均值的关系,基地14-16级都符合没后代的条件。
另外MK值和种群数量也是有关的。
首先挑选出来一部分可以确认同父同母并且无后代的个体,整理他们和父母的MK,见下图。图中我也注明了,二顺和美兰都有后代,直系二代亲属不包括父母,因此不在此表之中。

发现【】MK=父母MK均值+0.0006【】上图中出现0.00055是数据精度所致,因为只保存到小数点后四位,会有一定误差。由此公式可以推算16官方谱系已确认的父本。
此公式只适用于17概况书中MK,和其他途径得到的MK并不匹配!但因为父本一旦官方登记了就是确认了,所以推算出来父本不只适用于16官方谱系,除非之前或之后的谱系父本修改过。
因此可以用【】MK=父母MK均值+0.0006【】公式和17概况书中基地14-16级个体的MK倒推已DNA鉴定但未公布官方谱系父本的MK,众所周知,基地种公只有几个,并且这些种公的MK差距巨大,确定了MK基本就可以确认父本个体。
种公列表 MK
勇勇 0.0375
雄浜 0.0307
美兰 0.0275
福福 0.0238
乔乔 0.0056
推算结果见下图


得出的父亲MK和备选父本MK完美契合,误差不超过0.0001。
但出现了数个和其他来源网络资料不符的个体,比如双好的父亲推算结果为美兰,而实际上双好并没有美兰特征。文文和雅竹雅韵长相相似,之前一直说他的父亲为乔乔,但文文的MK高达0.0260,和其他乔乔子女差距巨大,这也是我做这个推算的原因。
出现不符的原因猜想,查阅15年概况书公开的14官方谱系内容,大双和雄浜美兰都本过,当年双好MK计算用的是两者各50%,但后来年份的概况书双好从父本未确认列表中除去,可见已经DNA确认了父亲。
因为谱系是人为上报登记的,不排除错误的可能性。另外17概况书的MK值也可能出现错误。我觉得在双好的父亲上,很可能确实错了,因为他确实和美兰一点也不像,反而和同父同母姐弟双薪双喜双雄都很像。