中量元素肥料主要是指硅、钙、镁、硫肥，这些元素在土壤在土壤中贮存较多，一般情况下可满足作物的需求，但随着氮磷钾高浓度而不含中量元素化肥的大量施用，以及有机肥施用量的减少，在一些土壤上表现出作物缺乏中量元素的现象，因此要有针对性的施用和补充中量元素的肥料。
常用的品种为：硅肥、钙肥、镁肥、硫肥
硅肥主要有硅钙肥、硅锰肥、硅镁钾肥、硅酸钠等；
钙肥主要石灰、石膏、过磷酸钙、钙镁磷肥；
镁肥主要有钙镁磷肥、硫酸镁、氯化镁等；
硫肥主要有普通过磷酸钙、硫酸铵、硫酸钾等。