1.心理影响：如果患者没能及时的治疗尿道下裂，随着年龄逐渐增长，尿道下裂将对孩子造成严重的心理困扰。一般情况下，应该在入学前完成手术矫治，因为这时阴茎已长得较大，孩子能主动配合手术，又能避免入学后的心理损害。
2.阴茎发育的影响：尿道下裂会严重影响男性的阴茎发育，从而形成阴茎短小或者阴茎弯曲等一系列生殖器畸形的疾病。
3.影响排尿。由于尿道外口在阴茎体部，当患者排尿时需要用手把阴茎头抬起来，并且尿流常呈喷洒状，容易尿湿衣裤，从而造成了患者的排尿困难，影响正常的生活。