男主遇到三个女孩：
红色的Anna, 蓝色的Elise，黄色的Jean.
Anna有火热的情感，非常懂得男主的心，即使分开后，仍然与男主彼此思念，相逢总是有极大的喜悦。
时间线1：与安娜幸福地生活在一起，并有儿女，在回家的车途中，落水而亡。
时间线2：与安娜分开，清理池塘，与安娜重逢于火车站。离别时安娜留下临时电话。电话被雨打湿，看不清。
2.1 男主在灯塔下苦等，并与安娜重逢
2.2 男主到处流浪，寻找这份真爱。（精神进入梦世界中）一直没有找到……
Elise代表深沉的理智，但蓝色也代表忧郁。男主与之相遇后，
时间线1：男主肉体瘫痪，但仍理智地构建着科幻的世界。现实中父母复合，虚幻中自己死于在流星雨中。
时间线2：Elise死于婚礼当天，男主走入理智的科学研究，进行各种理论的推演与现实的实验观察；同事死后，看到遗孀Anna。
时间线3：Elise死于婚礼当天，后来男主去火星洒了她的骨灰。在太空中遇见Anna。死于飞船爆炸。
时间线4：Elise 太过忧郁，结婚生子后，仍沉湎往事不可自拔，最后离家出走，一直守着旧时情人照片。男主则在创作时，死于洪水之中。
Jean 代表着宽容，富有，谐音：dream 梦想。
主人公一直活在梦想中，为了梦想而奋斗。不做随机选择，控制着一切。当梦想中的目标都达到了的时候，男主了无生趣，不想活下去了。最后，随机选择之中，丢掉了性命。
还有一个最公开也是最神秘的时间线，在三个女孩的名字中，也就是所有可能性都存在的一条不是时间线的时间线。百岁NEMO所在的时间线。
三个女孩的名字 anna elise jean, 重新分一下， an na else see jean—— an none else see dream 一场别人看不见的梦。 格子世界里的NEMO与百岁NEMO都生活在那个时间维度的空间里面，与其他各个时间线交织在一起。
又演绎出无数的可能性，比如说浴缸被杀那段，至少有四个不同NEMO出现，有非常多的不同神情。
在看到所有可能性的9岁NEMO，在当下有了一个新的方向，脱离了一切控制的方向，吹起一片树叶，让树叶来演绎着人生。