主要原因是冠脉CTA受心率、呼吸频率的影响，产生伪像的机率增多，如心率超过70次/分、心律不齐或心功能衰竭等情况下无法取得可靠的图像，此外CTA清晰和准确程度不如冠脉造影，冠脉细小分支不能充分显示；对冠脉血流的动态观察不如冠脉造影；对冠脉支架内再狭窄的评估受限等。

最重要的是，冠脉CT只是检查手段，而冠脉造影可以同时对适合的病变进行介入治疗。
因此简单地说，对于不能做冠脉造影，临床上不倾向冠心病但又需要排除冠心病，介入或搭桥术后疗效评估的患者可以选择冠脉CT；而临床上高度怀疑冠心病，很可能需要同时做介入治疗的患者，应该首选冠脉造影。