给人体补充益生菌要有针对性，即针对不同的病因及体质，添加不同的菌种，因为益生菌的好处因菌种的不同而不同，可以根据想要预防或治疗的特定问题，选择相应的菌种。要有针对性的添加才能有针对性的解决问题。

益生菌菌株存活环境要求高，对生产和包装工艺都有很高的标准要求，益生菌的载体最好的片剂、胶囊和粉末。

有的益生菌株不能经受胃酸（强酸环境）和肠液（碱性环境）的腐蚀，结果吃进的益生菌不能活到结肠，更谈不上繁殖了，吃了也是白吃。所以要保证益生菌的存活率，只有活菌才能发挥功效，我们没有必要补充一些益生菌的尸体进去。

添加益生菌后要留意观察人体的反应，毕竟是外部添加的细菌，不同体质人群的适应能力不同，某些体质的人群可能会有些免疫反应。