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ePlant:植物基因的可视化展现

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当前系统生物学研究面临的一个重大挑战来自于不同类型的数据必须从不同的来源获取并使用单独的工具进行可视化。导航这种工作流程所需的高认知负荷对假设生成是不利的。因此,需要一个强大的研究平台,它整合了所有的数据,并通过一个门户网站提供集成的搜索,分析和可视化功能。在这里,ePlant一个可视化的分析工具,通过一个可缩放的用户界面来探索拟南芥数据的多个层次。 ePlant连接到几个公开可用的Web服务,下载一个或多个感兴趣的基因或基因产品的基因组,蛋白质组,相互作用组,转录组和3D分子结构数据。数据是用一组可视化工具显示的,这些工具使用从大到小的概念层次结构来呈现,许多工具结合了来自多种数据类型的信息。我们在这篇文章中描述了ePlant的发展,并给出了几个例子说明其假设生成的综合特征。我们还介绍了将ePlant部署为Araport上的“应用程序”的过程。基于现成的网络服务,ePlant的代码可以免费用于任何其他生物物种的研究。{https://0x9.me/euxp5}


1楼2018-01-26 10:33回复