自体骨髓干细胞移植是近年发展起来的新技术。其方法是先从肝硬化患者身上抽去少量骨髓，再分离、提取骨髓干细胞，经培养，当干细胞数目达到一定量后，在介入条件下将分离出来的肝细胞经肝动脉注入肝脏，手术即完成了。其基本原理是基于干细胞有着很强的“因地分化”特性，就是在什么样的环境条件引导下分化成什么样的细胞。所以当干细胞被移植到患者肝脏组织后，就像种入肝脏的“种子”，在一定微环境调控下“入乡随俗”的成长发育为肝细胞，然后增殖长出新的肝脏组织，承担起病肝不能胜任的工作，促使病肝重获生机。它与传统肝移植相比，实施过程简单，不存在免疫排斥等问题，具有痛苦少、成功率高、风险小、费用低的特点。
临床证明，肝硬化患者及早治疗非常关键，一般而言，中、早期肝硬化、中毒性、炎症性、以及慢性损伤性肝脏疾病等患者，都适合接受骨髓干细胞移植。但是以下几种情况需要注意分别对待：
1、肝硬化终末期合并严重并发症，如严重消化道出血、严重肝昏迷患者；
2、恶性肿瘤患者、生命体征如呼吸、血压、脉搏不稳，合并严重感染的患者，年龄大于65岁及小于20岁者。
上述几种情况有的本身不是合作自体骨髓干细胞移植，有的则需要进行综合与处理和治疗后因情况而定。