宗教抵触了主流意识形态。基督教传教依其传统喜欢从贫困带入手，农村包围城市。基督教在清末传播，深入内地的时候碰到障碍，在江西，四川山东，这些地方绅族力量比较强，文化人比较多，但在浙南，在福建，教案发生不多，以前这些地方多山区，又封海，古代是粗放资源导向的发展，所以不是很富裕，儒家文化渗透低。基督教在传播中利用了宗族的能量。中国的底层民众其实一直比较迷信，古代，儒家对士绅比较有影响，往下很多老百姓是进寺庙，尼姑庵，道观，妈祖庙。庙里好几个神混在一起拜，喻义多少个教合一。
儒权下县其实没那么容易的，农村能识文断字的人已经是十里挑一。
如果按照征地能力作为基层政权组织的重要指标，实际上宗教跟农民起义挂钩很频繁，秦末陈胜吴广起义、汉高祖斩白蛇起义、汉末黄巾起义、晋末孙恩卢循起义、元末红巾军起义、晚清白莲教起义、同治陕甘回变、天理教暴动、太平天国等等，要么制造了灵异现象（谶语、民谣、石头刻字）或直接跟宗教有关（五斗米道、白莲教），而他们又打出平均地权的口号。那么作为一股反作用力。无论是共产、还是儒家，都要扼制的。