小光还在伤痛中回想哥哥的事。阿武唤醒她。与现实世界连接的裂缝出现, 大和带领众人回去, 路上大和停下回头记挂太一, 阿空也停下来, 叫大和想救太一的话可以去, 其他的我来照顾。大和说救世要紧。
异常的数码兽继续在世界各地破坏。国会中, 望月教授「我们要和世界各国联合对抗数码兽」,出来后发了讯息叫芽心报平安, 转角就遇到哈克兽, 望月教授「你们到底想怎么样,芽心没事吧?」哈克兽「没事,…秩序兽出现的状态下, 要实行那个计划了, 不然就没有未来可言」。
众人回到现实世界, 在光子朗的搜索下还是没秩序兽的下落。小光「都是我的错..哥哥呢?..」然后发烧倒下, 美美哭。芽心也说是自己的错, 阿空叫她别想这些要向前看。大和走去阳台外, 加布兽也跟随着安慰他, 说伙伴守则中如果出现烦恼的话要和伙伴说, 大和笑说道「这我是第一次听啊」, 加布兽「当然,我才刚想出来的」以后也会一直陪伴着大和, 等大和有孩子之后能帮忙照顾, 大和成为老人后能陪他散步之类的感人对话, 之后一人一兽相拥而泣。一众数码兽隔着落地窗后在偷看, 突然加布兽发现天空上方出现裂缝, 大和戴上护目镜看到高能反应, 秩序兽出现。秩序兽经过的地方都会数据化消失, 也能下同样效果的血雨, 整个台场因为秩序兽的出现变得破烂, 警察疏散人们到安全的地方, 阿武陪小光休息其他人应战。五兽(加布,哥玛,甲虫,比丘,巴鲁)成熟体进化场面>完全体进化场面>空中战不够打>究极体进化场面>秩序兽吶喊攻击,全究极体爆炸,炸回幼年期II。玄内在天台上边看边自演乙自high, 哈克出现, 玄内「你们的所作所为到头来还不是和我们一样」哈克「理念不同..恒常性追求平穏和调和」玄内「什么是平穏什么是调和?....还不如把这恶心的世界一切消除掉在世界树的意志下重建..」。
哈克在被选中的小朋友们于压倒性的力量下被打败后出现, 哈克「我是你们的朋友」,光子朗用计算机一查「哈克兽…究极体是..杰斯兽!?」众人怒, 美美「都因为你(那攻击)事态才变成这样你还来干什么!」哈克「…秩序兽是毁灭现实世界和数码世界的锁匙..要救世就是要把秩序兽这锁匙重启让牠回到成为锁匙前…原本现实世界和数码世界的构成不同重启法则不同…但现在现实世界和数码世界交错之时…现实世界已经被影响能够有数据的性质…现实世界的重启会在某树的意志下进行, 要救世别无他法」现实世界的重启不会影响人类, 数码兽能进入sever保护免受记忆初始, 关键是数据化的设施如政府总部, 下水道等等机建会重启为世界带来灾难性影响。大和「太一这时候会怎样决定了?...」光子朗「我不同意, 我自己再找方法」然后跑回去了。哈克兽要求芽心引导秩序兽去台场海浜公园面向东京湾的水域,那里能减少作画成本..不, 能减少待会战斗中街道上受到的破坏。

另一边厢, 太一醒来发现四周一片漆黑, 西岛「你醒啦..太一..」太一把手机照明打开, 西岛一身血, 腹部自行包扎过。突然房间灯光在计算机屏幕在省电模式下亮起, 屏幕前方的窗后有一个大房间, 房间中立着一个个生命维持胶囊, 而在里面的是02主角等人(全身看不到, 只有黑影轮廓)。西岛解释道他们只是睡眠中没事, 这里应该是数码世界中世界树的其中一个设施, 其实02等人一开始就失联了, 只是用权力封锁了相关讯息, 也瞒着太一等人。而把他们关起来的是姬川, 她为了重新和她的数码兽在一起, 一早就和世界树玄内连手了。这时玄内出现, 嘲讽了太一他们一轮(有出现童贞的用词)就把02等人的生命维持系统关了, 要救他们的方法只有一个, 就是把02他们立刻送回去现实世界, 但同时设施会倒塌, 太一和西岛会没命。玄内「…这也算是世界树的慈悲吧..」玄内离开, 太一操作计算机屏幕想找其他方法, 西岛建议(骗)太一去房间里唯一一个空着的胶囊里找有没有能和现实世界联络的设备。当太一一进去后,西岛就关了胶囊的玻璃门, 把他和02等人送回去现实世界,留下重伤的自己等倒塌。太一一直打门叫老师, 西岛「…未来交托给你了…」举起血红的拳头后无力放下, 太一等人顺利被送回现实世界, 设施倒塌。
大和接到光子朗的电话说02等人在现实世界被人发现,现在送了去医院。伙伴兽们吃完东西后有力气了, 众人已到海边, 芽心站了出去「缅因兽真的会跟过来的吗?」哈克「根据推测是这样没错, 秩序兽体内还保留一点缅因兽的意识..会本能地去到你身边…然后其实当初重启也不是我的本意」哈克兽很明显有出于私心帮助他们的想法。秩序兽开始向芽心移动。太一的生命维持胶囊在台场海浜公园滩中留下, 向着战场出发中。秩序兽停下来后自卫队战机直升机坦克大炮舰炮等发动攻击, 秩序兽当然无伤, 要反击自卫队时众兽成熟体进化应战, 只有加布完全体进化。光子朗和甲虫兽在家。
小光在床上醒来, 阿武递水, 小光说自己也一同消失就好, 阿武要小光振作。小光看到秩序兽在窗外远方就出门。一出门遇到一群异常数码兽, 巴达兽>天使兽>神圣天使兽, 刀光剑影一番。玄来出现在他们面前, 嘲讽一轮并召唤出恶魔兽,和神圣天使**战。阿武带了小光去安全的地方, 小光又发动特殊能力, 脑海里在巫师兽背影的引导下去到迪路兽和缅因兽的面前, 迪路兽说缅因兽很自责一直想办法把迪路兽弄回小光身边。迪露兽留下「全てのひかりはメイクーモンの中に(全部的光(希望)就在缅因兽之中)」小光醒来后重复这一句, 阿武听到后打给光子朗, 光子朗说以小光不可思议的能力, 并不奇怪, 可能有某种提示。这时重启倒数已经开始了(10分钟)。

光子朗打了给大和, 要他们去桥下集合, 集合后小光根据想到的推测, 借了芽心的暴龙机连上计算机, 果然芽心的暴龙机(缅因兽之中)有玄机, 之前重启时缅因兽没有被从置记忆的原因是因为芽心的暴龙机里面有缅因兽记忆备份, 同时其他数码兽的记忆备份也在里面, 之前缅因兽究极体时的强大性就在于牠体内有着其他伙伴数码兽的记忆数据。此外, 有一个被锁上的文件夹, 锁着缅因兽以前和芽心相处时的记忆数据, 因为被锁上的关系导致和芽心的伙伴关系压不往体内的黑暗力量, 从而暴走。目前只要把记忆备份还到所有伙伴兽上, 和解开缅因兽那个被锁上的文件夹后就能停下秩序兽(缅因兽)的行动并改变局面, 阿空叫芽心想想有什么话是缅因兽经常挂在口边的, 或者第一句和牠说的话, 芽心想起来, 一输入就对了。密码就是「dandan(谢谢)」, 这样一来全部伙伴数码兽的记忆都回到牠们身, 一只一只开始回忆片段, 然后究进。秩序兽也因为缅因兽和迪露兽取回记忆的关系停了下来, 开始要分离出来。光子朗说开始见效了, 叫哈克兽暂停重启, 在秩序兽想逃走前, 哈克兽空间移动到裂缝口, 变成杰斯兽阻止并斩掉秩序兽其中一片翅膀, 分离出迪露兽, 然后就离开去关掉重启(最后是停在11秒)。缅因兽被世界树利用下不能分离, 黑暗数码兽重组出翅膀, 芽心看到迪露兽都出来了, 但缅因兽没有就着急地向秩序兽, 大和要阻止秩序兽翅膀向芽心和大攻击, 避开后芽心逃上岸, 亚古兽跑去保护芽心,快要被插到时太一跳出推走了她们一同躲开了攻击。众人喜,大和和太对视, 大和「大慢了吧」
播歌(butter-fly), 亚古兽>暴龙兽>机械暴龙兽>战斗暴龙兽+钢铁加鲁鲁兽>奥米加兽, 全究极体参与。小光叫太一别那么狠「每个生物都有光和暗的一面, 但我相信光的一面」大和「我们不是被选中的小朋友了, 而是要作出选择了」太一「你就静静看着, 即管恨我吧」奥米加攻击。小光「我可能不会原谅, 但我不能只看着, 我也加入战斗」迪露兽>圣龙兽。众人做好杀掉秩序兽(缅因兽)的决心, 打了一轮(开始赶收尾), 芽心暴龙机发光变成白色蓝线暴龙机, 众人的暴龙机也变成一样的颜色。奥米加兽和全部伙伴究极体低下湖面出现光芒, 众究极体变成不同颜色的光,飞到奥米加兽的胸前螺旋式进入>奥米加兽:仁慈模式诞生(这里并没有任何说明为什么芽心的暴龙机会发光和会变成奥米加兽:仁慈模式原因是什么)。接下来奥米加兽:仁慈模式就开始虐秩序兽了,先是加鲁鲁炮,一条超长光线射出但没有断开, 像是一把激光刀打横一切, 秩序兽双翼上半部全被割。再来暴龙剑, 向上高举刀身聚光, 变出一条发光长鞭挥几下, 秩序兽的四肢立刻七八分离。最后一下向中间全力一鞭, 秩序兽一分为两。芽心在光影中看到缅因兽和自己「dandan」挥手, 芽心泪流满面。玄内回收了黑色正方体, 口中说道「…谁的内在都有一颗小孩子玩耍的心…下一个找谁呢?...超恶魔兽(迪亚波罗兽)吗?」然后就消失了(这里应该指数码暴龙大电影- 超恶魔兽的反击)。

…三个月后, 数码兽都回去数码世界了, 光子朗为了种种种种(来不及听)着手研究D-3自由进出数码世界的功能。大和阿空阿武三人行, 大和「我就以宇宙为目标吧!」阿武无视「咦!阿空你剪发了耶!」阿空「是啊」大和「eh?(没察觉)」阿武「你真是的」…圣诞节前后的一个晚上, 众人聚集在一齐, 看太一打电话给回了老家的芽心(太一有脸红)「(众人送的圣诞)礼物收到了吗?虽然发生了各种事情…但是(说不出口)」亚古兽抢话「不管发生什么事我们都是伙伴!」芽心泪。
播声优合唱butter-fly ED。完。

好可怕的剧情

看了这个剧情，觉得第六章没有那么不堪。但是确实还是有太多坑没填，除非要出续作。那个黑色的正方体应该是第一章的开头掉进数码蛋的那个，也可能是启示录兽的碎片。而玄内说继续寻找目标。况且玄内为什么成了世界树阵营，这又发生了什么，看来没有交待。感觉也确实可能会有续集。
不过控制二代居然是姬川的意志，这真的想不到。以前只是觉得她只是被利用了。

从2ch上转的一段，百度翻译了一下
因为如此，数码世界和现实世界的边界已经消失了
孩子们回到了现实世界，光因为高烧而倒下了
决心代替太一的大和和支持那个的加布蒙
在没有牙齿的绝望的孩子们面前，哈克蒙出现了
为了让所有的混乱都强制结束，现实世界也会重新启动
但是，如果所有的数码设备回到初始状态，就不知道现实世界会发生多少混乱
自己在反对的最后找别的方法，光子郎离开了。
哈伦把戴眼镜给东京湾吓到了。
在数码世界里，西岛和太一被关在神秘的房间里，在那里，02个成员也
被抓住了。他们一直下落不明。隐瞒那个信息的是姬川
现在这样的情况是因为自己没有阻止公主。无论多么痛苦的决断
有不得不下达的事情。即使对方是伙伴也很后悔的西岛
出现在那里的假光不改变将生命维持装置的功能切断。将帮助转移到现实世界
但是，如果实行的话，这个房间就会爆发。转送胶囊还有一个人的西岛
骗太一送去转送胶囊
在现实世界上，出现在东京湾的奥德里奈受到了自卫队的攻击
疾驰的光与毛巾蒙中的特尔蒙进行对话。被泰尔蒙传达了
光子郎将“所有的光都放在梅库里”的话，在以前的备份数据中
对混混的梅库蒙的数据进行了调查，发现了所有数码兽的数据都是内部的。
（没有什么说明）
并且，在梅库蒙的数据中有被封锁的部分。要打开这个密码，需要密码。
密码是最初戴着眼镜的话的话。“渐渐”（高高）
所有的数据都被解放了，得到了重启前的记忆的数码兽们（在这里我们的无印音乐利用）
如果数据恢复了的话，就不需要重音了。为了停止重发，向我传达给我
呼吁哈克兽的光子郎
为了回应这句话，吉爱斯文也回避了想要逃到数码世界的海参
之后，从Hardientamon分离出来的特尔文，但是奥尼蒙的暴走无法停止（理由不明）
自卫队攻击暴走的Hardonon。“小梅说了什么！不要再痛苦了！
等不明白意义的供述愚者一技的战火攻击开始**眼镜
保护受到攻击的眼镜的是太一（在这里有歌词的Butt-Fly）
从现在开始就不杀人，讨厌杀人的氛围（不想说明）
由奥梅格蒙登场。泰里德拉蒙的终极进化（无歌词Butt-Fly。在杀人的决断后
可以变成被浮躁的蝴蝶吗？）
不知道什么的，眼镜的戴维斯闪闪发光，在奥梅格蒙上产生了翅膀
喂喂喂喂喂喂喂喂一刀两断。眼镜好的家伙在精神世界里进行对话（这之后吉他Buter-Fly）
从那之后三个月。街上进行了复兴。太一改变了前进的道路，去了预备校
“那么，我是宇宙中也作为目标的吗”，不明白意义的供述的大和
圣诞节大家聚会，太一代表鸟取回去了眼镜打电话给您您哦噢优柔寡断
“不管发生什么我们一直是朋友所以”（挤进唯一的东西合唱Butter-Fly与节能ED）

所以最后一部没有阿尔法什么事咯？阿尔法的出现有什么意义？有时候觉得整部都是一个坑。