「数码兽编年史」与数码怪兽卡片游戏的联动
以数码兽编年史故事背景为基础的数码怪兽卡片游戏包括进阶包第20到23弹、新手包9-10弹，以及究极战斗包「X进化卡组」。
Booster 21 ～X歼灭部队的威猛～

Booster 22 ～觉醒·禁忌的黑暗进化～

Booster 23 ～编织创世纪的人们～

以下卡片介绍了数码兽编年史的世界观与故事线：
第1~10章
第1章 数码世界的危机
超过预测的数据量的肥大化，数码危机的危机！

第2章 伊古德拉希尔
为了消除成为超负荷的数码兽，“伊古德拉希尔”发动了“X程序”！

第3章 新世界NDW
由「过去」、「现在」、「未来」三层组成的新数码世界！

第4章 X-进化！
强悍的数码兽与“X程序”对抗，获得了“X抗体”！

第5章 奥米加兽袭来
拥有X抗体的数码兽，被遵从伊古德拉希尔的皇家骑士排除！

第6章 新的飞翔
在薇儿丹蒂终端旅行的堂本光一和多路兽

第7章 兀儿德终端
通过X抗体增加凶猛性的古代恐龙数码兽的世界！

第8章 神秘的大地
救世龙传说的发祥地、罗兰大陆！

第9章 水宝玉的加护
通过水宝玉解放传说之龙「王龙兽」

第10章 公爵兽的启示
“X-进化数码兽啊，让我来看看你的力量吧！不然就排除了！！”

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第11~20章
第11章 薇儿丹蒂终端
在掌管「现在」的世界里，新的物种持续诞生！

第12章 圣剑，坠落大地！
面对究极的X进化、被逼入绝境的圣骑士！

第13章 全部删除
究极的奥米加兽力量！“删除数码兽……”贯彻到底，使命！！”

第14章 死之X-进化！！
死后进化！疯狂的虚拟生命体觉醒！

第15章 紧急传送
不可分析数据的「死亡X -进化」的紧急传送！！

第16章 新的羁绊
相信自己和伙伴，到最后都不会放弃的坚强的心！

第17章 斯库尔德终端
有很多人工进化种，发展的「未来」世界。

第18章 破灭的使徒降临！！
没有数码核也会继续存在威胁的「死亡X -进化」

第19章 奥米加初始之力！！
“以上的X抗体的影响必须坚决排除！”

第20章 维系希望的伙伴
赌上未来和生存，勇者们在时空间上移动！

第21~22章
第21章 圣剑召唤阵的启动！
“出来吧，然后把一切都解放出来！”召唤·圣剑格雷踏法！！

第22章 究极战刃王龙剑
得到了传说中的巨龙之力的孤高的圣骑士啊，突破世界的未来！！

所以剧情来看是普奥不敌多路战龙，X进化后又反杀对方，然后多路战龙变成了死X？

「数码兽编年史」
版本：1.0-1.5
「现在」之章「X-进化」「死亡X-进化」
异样的神秘的生命体数码怪兽
某日，具有人工智能的病毒在全世界的计算机上蔓延开来。这种病毒在网络上改变形态和性质，像生物一样进化的就是「数码怪兽」，俗称「数码兽」。

掌管数码兽一切的数码核是作为生命体的程序与数据，是0和1的数字和符号的集合。在人类眼中看到的怪兽和改造型等姿态，全都是由数码核的信息反映出来的。
进化
数码兽从数码蛋中诞生，以程序和数据为食物并通过在战斗中获胜获得成长，有朝一日改变姿态「进化」。而且寿命燃尽会死亡，再次变回数码蛋。

数码兽的进化分为等级，位于最高位的是究极体，以上是完全体、成熟期、成长期、幼年期。进化成强力的究极体，在现实世界的网络上也应该是强有力的兵器。
数码世界
数码兽生息的世界就是「数码世界」，由神秘的主计算机「世界树」管理着整个世界。

有种说法称，数码兽是世界树在数码世界进行实验而诞生的生命体。

「数码兽编年史」
版本：1.0-1.5
「现在」之章「X-进化」「死亡X-进化」
数码世界面临崩溃的危机！
数码危机
然而数码兽们的数据量巨大化程度超过了世界树的预测，包含数码世界在内的全宇宙规模的大爆炸「数码危机（Digital Hazard）」迫在眉睫。再这样下去数码世界将面临崩溃。

数码兽的特征在于「进化」，他们会一口气让数据量肥大化并进化。让后再通过网络从数码世界外部流入信息，因此进行不规则进化的情况非常多。
-PROGRAM X LOAD-「将所有数码怪兽删除！」
为了回避这场危机，世界树决定舍弃旧式数码世界，启动转移到新世界的计划。于是为了删除对于新世界无用的数码兽，执行了数码兽删除程序「X程序（X Program）」。

这个计划被称为「方舟计划」，内容是将超负荷的数码兽全部一扫而光，只将世界树认为有必要皇家骑士和研究对象传送（Upload）到新世界。
就这样，主计算机世界树放出的「X程序」删除了数码世界全域的数码兽。然而……
数码核突然变异？强大数码兽进化生命！
幸存的数码兽被发现了！只有强大数码兽的数码核本身会产生变化并生存下来，这正是未知的数码兽。
X抗体数码兽
数码核竟然自己摄取X程序并让构造脱胎换骨，然后诞生出对抗摄取的X程序的「抗体」并纳入到了数码核内部。

X抗体会对数码核直接造成影响，并具有高度导出数码核内信息的能力。因此，就能够发挥潜在能力级别而言，过去的数码兽完全不能与之相提并论。另外，受其影响，外形也发生了脱胎换骨般的变化。
然而数码核内的X抗体持续感染X程序的话会消失。恐惧死亡，互相争夺能使自己变强的「X抗体」的弱肉强食的世界来临了。
再次幸存下来的数码兽们一个个地逃向了X程序触及不到的「NEW数码世界」……
新数码世界（NDW）
新数码世界由三层（Layer）构成，分别是
恐龙等古代种繁荣的「过去」——兀儿德终端（Urd Terminal）
多样化诞生的「现在」——薇儿丹蒂终端（Verdandi Terminal）
人工进化种居多的「未来」——斯库尔德终端（Skuld Terminal）
这是一个通过层间转移连时间都能穿越的世界。

「NDW」位于主计算机之外，是个不会为主计算机自身积蓄数据的安全的假想实验空间。三层「编年史层系统（Chronicle Layer System）」采用数据分散化设计并能根据数码兽的进化状况进行有效的管理。

「数码兽编年史」
版本：1.0-1.5
「现在」之章「X-进化」「死亡X-进化」


强制删除X-进化数码兽排除异分子！来自圣骑士的肃正
以「X程序」无法删除已完成X-进化的数码兽。于是世界树对皇家骑士下令「强制删除」逃进NDW的X-进化数码兽！皇家骑士是位于网络安全最高位的圣骑士团，由于圣骑士奥米加兽压倒性的实力，X-进化数码兽们全都被消除，并濒临灭绝的危机……

圣剑，坠落大地！
但是，某个X-进化数码兽与其驯兽师毅然站了出来！完成究极的X-进化的多路战龙兽压制了皇家骑士！

贯彻删除数码兽的使命！
然而奥米加兽不管面对怎样千钧一发的危机，都不会背对敌人。发誓效忠世界树，即使成为异分子也要贯彻使命……为了这场不容失败的战斗，奥米加兽自己完成了X-进化！
太强了……在获得了可谓是无敌力量的奥米加兽面前，多路战龙兽败北了。一切看上去都结束了……

XAI系统
X抗体影响着数码兽本身。能最大限度激发数码兽在生态（空腹、筋力状况等）和进化，特别是攻击方面的潜力。「XAI系统」是显示其X抗体状况的系统。

「X-Antibody Indicator」X抗体指示器，简称XAI系统。是当初世界树为了发现拥有X抗体的未知数码兽，以技术开发并成功小型化的追踪监视装置，可以搭载在携带机「摇摆机X」上。

「数码兽编年史」
版本：1.0-1.5
「现在」之章「X-进化」「死亡X-进化」


死亡X-进化
被打倒的多路战龙兽的身体被漆黑的黑暗包围……即使死亡「X抗体」还要求数码兽寻求进一步的进化。其结果就是如同从地狱中觉醒一般，「死亡X-进化」发动了！

纵使肉体腐朽、意志消亡，却依靠本能无差别捕食数码核维持「活动」的疯狂假想生命体死X多路战龙兽出现了！

「数码兽编年史」
版本：2.0
「过去」之章「X-CAST」


来自圣骑士的考验
「持有X抗体的数码兽异分子，如果你们是代替我们的存在……就击败我公爵兽，展示你们存在的意义吧！」

在这场战斗中活下来的数码兽或许才是「战斗种」数码兽的正统进化姿态……
「展示你们的力量吧！否则我将清除你们！」在逃进NDW苟延残喘的数码兽面前，公爵兽杀出，并对他们提出壮烈的考验。


古代世界「兀儿德终端」
这是一个由X抗体激发出野兽狰狞性的古代恐龙们跋扈的弱肉强食的世界，最危险的地区。

王龙传说
在遥远的东方之地，奉上清澈的水宝石……水宝石将化为大河并升起。

穿越这片危险地区，有谁能解开「王龙传说」之谜，成功突破公爵兽的考验呢？

由于NDW的建设，流传于旧数码世界的传说和预言也被移植到了各终端。不过，「王龙传说」是旧数码世界所不存在的关于龙型数码兽的新传说，传说由于「水宝石」而觉醒的王龙会化身为「救世龙」，凭借众神的力量拯救世界。