1932年3月,被戴笠安排在浙江警官学校特派员办公室作文书,开始特务生涯。
复兴社特务处扩编为军统局。毛人凤任军统局机要秘书。1941年,他以代理主任秘书的头衔,负责秘书室的工作。此时毛人凤对人谦和,从不摆架子,因此得到戴笠的信任,戴便把军统的工作交给了毛人凤。有了与蒋介石接触的机会,他把握住了,得到了蒋的信任。在军统局造成了一种无形的领导地位。
戴笠丧命后,蒋介石听从了毛人凤的意见,由郑介民任军统局代理局长。为的是先把唐纵排挤出去。1946年10月,军统局改组为国防部保密局,郑介民兼任局长,毛人凤任副局长。由于毛人凤百般逢迎老乡俞济时,俞在蒋的面前为毛说了不少好话。与此同时,毛人凤处处与郑介民作难。他派沈醉从各方面搜集郑介民大肆贪污的材料,向蒋介石汇报。俞济时也不时地向蒋介石的坏话。在多方攻击下,郑介民被免去了保密局局长的职务,毛人凤坐上了这把“金交椅”。