万历三十五年(1607),杨涟在会试中进士及第,授职常熟知县。初到常熟,杨涟就到城隍庙,与城隍神相约,自己在任职期间绝对不会出现“不秉公而徇绅豪者”,并对天发誓曰:有如日。”根据“《东林列传》卷三记载,在常熟任知县期间,杨涟可谓尽心尽力,在公务的闲暇时间,他时常和常熟当地的读书人“相勉励”,“讲道论德无虚日”。为了了解当地真实民情,他常常青衫布履,深入田间、民舍,微服察访。他对闾里百姓的利病以及所需、所急了如指掌,并积极为他们谋划,大力改善民生,因而深受当地群众的拥戴,被人们尊称为“当代神君”。杨涟铁面无私,秉公执法,为民请命,在苏州官场营造了一种良好的风气,甚至于杨涟“在省垣,四方货贿不敢窥其门”。在常熟知县任满之后,杨涟回京参加吏部举行的官员考核,在所有京察的官员中,他因在常熟卓有成效的工作和良好的口碑而被推举为“廉吏第一”,升为户科给事中。