1984年，英国莱斯特大学的遗传学家Jefferys及其合作者首次将分离的人源小卫星DNA用作基因探针，同人体核DNA的酶切片段杂交，获得了由多个位点上的等位基因组成的长度不等的杂交带图纹，这种图纹极少有两个人完全相同，其个体识别能力足以与手指指纹相媲美，故称为“DNA指纹”，由于其特异性较强，而被应用于亲子鉴定中。

随着技术的进步，鉴定亲子关系的方式也随之变化，目前最常用最准确的则是DNA-STR鉴定，人的血液、毛发、唾液、口腔细胞等都可以用于亲子鉴定。

而DNA-STR鉴定的科学原理则是基于孟德尔定律：两个数字相同，就代表纯合子，不一样的就代表杂合子。纯合子无论如何只能出来一种配子，而杂合子可以出来两种类型的配子。目前正是根据这一定律，进行亲子鉴定。