精子问题：环境污染、食品安全以及辐射等因素正在损害着男人的精子，造成男性因素流产的急剧增加。
内分泌失调：胚胎着床及继续发育依赖于复杂的内分泌系统彼此协调，任何一个环节失常，都可致流产。
免疫因素：妊娠宫内的胚胎或胎儿实属同种异体移植，因为胎儿是父母的遗传物质的结合体和母体不可能完全相同。
子宫异常：子宫里的内环境和子宫整体的环境都有可能对胚胎有影响。
染色体问题：如果染色体异常的话也会导致胚胎不发育而致早期流产。
环境 因素：妊娠期生理状态的改变、使母体对治疗药物和各种环境有害物质的吸收、分布和排泄发生了较大的改变，在发育初期，胚胎对治疗药物和环境因素的影响极为敏感，此时各种有害因素都可导致胚胎的损伤、甚至丢失。
生殖道感染：除以上各种因素外，感染所致孕早期流产愈来愈受到国内外学者的重视。