为什么说在DOS下刷BIOS和EC会比较稳？

我刚修好EC回来（见帖：http://tieba.baidu.com/p/6147928448），发现在windows下刷BIOS被写入了保护，可能是因为我刷死之前恢复过神舟出厂BIOS：1.05.12。现在双击D大的解除保护也无效。只能尝试考虑进DOS下刷。
但是有个疑问：“为什么说在DOS下刷BIOS和EC会比较稳？“
现在不敢随便动，但又不能不动。目前风扇和声音都还不是正常匹配的状态。
求有经验的能为我解惑。