事实上金刚菩提子，真实的内涵是印度教（尼泊尔等国家的国教）中“湿婆神的眼泪（或者眼球）”。“ 湿婆”这个名字是在印度教时代出现的，象征着“昌盛”和“吉祥”，同时又象征着“毁灭”。佛教文献称他为大自在天，住色界之顶，为三千界之主。有地、水、火、风、空、日、月、祭祀八种化身，拥有毁灭和再生的力量。
而他长在前额上的第三只眼更是一件比核弹还可怕的武器。这只眼平时总是紧闭着，一旦睁开就会喷出毁天灭地的愤怒之火，摧毁所看到的一切，就连神也不能幸免。曾经引诱湿婆的爱神，就是被这只眼烧成了灰烬。
而金刚菩提子的传说就是来源于此，因此常常有人认为金刚菩提子，代表了坚硬无比,无坚不摧,能摧毁一切邪恶势力。因而金刚菩提也被当作是驱邪避祸的护身符,保佑身体健康,远离疾病和一切不好的事。