日本的内窥镜检查主要是针对肠胃检查的。胶囊内镜也是日本内窥镜检查的一个手段。它全称 “智能胶囊消化道内镜系统”，顾名思义就是一个会拍照的胶囊。胃镜的内窥镜检查一般都是胃镜管前端装有内视镜，由光源器所发出强光，经光纤使其转弯，让医生从另一端显示屏幕上清楚地观察上消化道内各部位的状况。必要时，可由胃镜上的小孔伸入夹子取细胞切片检查（活检）。日本的内窥镜检查相比国内的特别之处应该是在于内窥镜管子的粗细和鼻腔进入式的检查。