首先肛周脓肿和肛瘘是同一种病，是肛门直肠周围软组织间隙发生的感染。肛周脓肿是感染急性期，肛瘘是慢性期，变化时间大概2周到3个月。
肛周脓肿变成肛瘘后具备三个要素——肛隐窝内口，纤维化上皮化管道，皮肤破口外口，这三处都有慢性炎症残留，所以可能会反复感染发生急性肛周脓肿，所以需要再次手术切除肛瘘才能治愈该种疾病。