如果说，从无机物到有机物还有个似是而非的米勒实验的话，那么从有机物到所谓生命物质，从所谓生命物质到细胞，则是找不到任何证据，进化论者大约是很希望病毒之类的类似生物能成为有机物到细胞之间的过渡，然而很不幸的，病毒无法脱离细胞液的环境而长期存活复制。这使得任何把病毒打扮成细菌祖宗的企图都成为笑话。

到了现在这一步，哪怕进化论者也知道，进化论是解释不了生命起源的，所以他们转而求其次，进化论者开始辩解说进化论并不是解答生命起源的学说，他只是用来解释物种改变的学说。看起来，进化论者大约是想调低目标在解释新物种产生和旧物种消亡上打出一片天地。
但是很遗憾，横在进化论者面前的依然是重重高山险阻。我们来看看其中的一座高山，它叫寒武大爆发。大约5亿4200万年前到5亿3000万年前，在地质学上被认为是寒武纪的开始时间，寒武纪地层在2000多万年时间内突然出现门类众多的无脊椎动物化石，而在早期更为古老的地层中，长期以来没有找到其明显的祖先化石的现象。类似的生物大爆发，在生物史上还不止一次，面对这种现象，进化论者做出的辩解大约是两个，第一个，认为这是化石缺失，这种毫无新意的辩解很快就被否认，因为在之前的地层发现了大量蓝绿藻的化石，第二，认为是氧气的丰富催化了生物的突然变异，然而在早前的地层发现了大量过氧化的岩石，同样否认了这点。

与生物大爆发相比，生物大灭绝同样对进化论构成了极大的挑战，通常认为，地球历史上有过5次生物大灭绝，每次生物大灭绝持续时间通常在几百万年到上千万年，问题来了，如果进化论者认为从猿进化成人也不过用了几百万年，那么何以这几百万年时间那么多灭绝的动物却进化不出适应环境的基因呢？尤其是第一第二次大灭绝被认为只是地球变冷造成的，难道生物进化出一个抗寒基因，比猿进化出个人脑，进化出一个文明更难？这显然是说不过去的。

说到这里，做个小结，在进化论者看来，生物的演化是从低到高的一条平缓曲线。然而实际上我们认真捋一捋以后发现的却是一种锯齿线，单细胞生物是突然出现的，没有发现有前置生物，出现以后几亿年都没什么明显的变化，突然之间，寒武大爆发出现了一大堆的无脊椎动物，也是没有任何前置生物，当无脊椎动物出现以后，又是很长一段时间没什么明显改变，甚至生物多样性还逐步减少了，直到奥陶纪，又一次毫无预兆的生物大爆发。规模甚至比寒武大爆发更大。说实话，这看起来更像是人为干预的结果，而不是自然进化。结合热力学第二定律，每次的生物大爆发，完全可以看做是输入性的低熵，而之后的生物多样性下降，则是输入停止以后的自然熵増。

唯物主义要成立，我想首先要证明物质可以产生精神，如何证明物质可以产生精神？我能想到的必须解答的问题有三个，第一，证明无机物可以通过自然演化产生生命乃至智慧生命，第二，证明人脑可以产生自我意识。第三证明宇宙起源于物质。只有唯物主义者能通过科学研究解答这三个问题了，他才能说自己是科学的，否则科学在何方？
而通过以上的陈述，可以看到对于第一个问题，进化论是无能为力了，唯物主义旗下恐怕也没有其他理论可以回答这个问题，所以我们接下来看第二个问题。
人脑可以产生自我意识么？或者说，自我意识是人脑产生的么？回答这个问题前，首先要定义什么是自我意识，应当说，自我意识是有很多层级的，各种动物的自我意识层级都有所不同，然而最基本的自我意识应该是趋利避害，为什么这么说?因为很显然，只有有自我意识的实体才需要趋利避害，如果连自身存在都不在意，甚至尚未意识到的实体，需要趋利避害么？显然不需要。所以，趋利避害是最基本的自我意识，可以说，所有动物的其他的各种行为都是这个基本行为的衍生和发展，包括人类。
现在，我们就可以看看自我意识是不是人脑产生的呢？显然不是，学过初等生物的同学都能知道，哪怕单细胞动物，比如草履虫，它都是有趋利避害的行为特征的，而草履虫显然没有大脑，它仅有一个细胞而已。那么能不能说自我意识是细胞产生的呢？其实也不能，因为上面说了，细胞或者说单细胞动物是突然出现在地球上的，当它出现的时候就是带有自我意识了，我们并没有找到单细胞动物从无趋利避害行为到有趋利避害行为这样的演化过程。所以，我们无从判断草履虫的自我意识是怎么来的。自然也不能说细胞产生自我意识了。

以上，我们可以看到，由于单细胞动物的趋利避害特性和他本身是同时出现的，所以我们只能说无法证明细胞能产生自我意识，当然咯，也无法证明细胞不能产生自我意识，所以我们需要换一个观察对象，选择一个合适的观察对象是非常重要的，所以我以为人本身是一个非常合适的观察对象，所以问题就变成了，人的自我意识是大脑产生的么？那么怎么判断这个问题呢，很显然，人的自我意识和人脑是同时出现的，至少对于我们的观察来说是如此，这和单细胞动物是一样的，所以我们需要换个角度来观察，比如，假设人脑可以产生自我意识，并且，人脑是自我意识的物质基础，那么我们可以推断，假如我们改变这个物质基础，必然会同时改变人的自我意识，如果人脑这个物质基础被明显的改变了，但此人的自我意识却没有相应的改变的话，我们就能反推这个假设不成立。
很幸运的，医学上有两种病例可以给我们提供参考，第一，裂脑人，众所周知，人脑是由左右两个半球组成的，两个半球是各自独立工作的，他们之间的信息交流通过名为胼胝体的神经组织进行，而裂脑人，则是被切除了胼胝体的人，他们的两个大脑半球各自独立工作，各种试验表明，裂脑人的左右两个大脑互相并不知道对方看到了什么，也无法表达对方所感知到的东西。好，现在问题来了，假如自我意识是大脑产生的，那么大脑分裂成了两个，自我意识是不是也该分裂成两个？张三成为了裂脑人是不是应该觉得自己身体里多出了一个李四？然而很遗憾，各种试验都没发现裂脑人有双重人格出现。
那么，是否是因为两个大脑半球才能产生一个人格意识呢？并不是，医学上有反例，即多重人格，表现为一个人身上显示出两个或两个以上不同“角色”的人格特点。这些不同的“角色”各自有着自己的行为习惯、思考方式、自己的生活环境和对自己的认知，轮番主导一个人的行为，有如“在一个身体里住着几个灵魂”。有趣的是，多重人格的产生并不需要大脑受到伤害或者改变。他的产生往往是因为受到情感伤害，而不是大脑伤害。
综上，如果我们认为人的自我意识是大脑产生的，那么该如何解释与这个假设完全不符的现实病例？通过以上病例，我们只能认为，人的自我意识不可能是大脑产生的。然而还有更为极端的例子

更极端的例子是什么呢，半脑人，也就是因为某种原因，而被切除了半个大脑的人，如果人的自我意识是大脑产生的，那么少了半个大脑必然会对人的自我意识产生影响，然而从各种公开报道来看，从未听说半脑人的自我意识出现问题，如果自我意识是灵魂的话，那么并没有哪个半脑人报告说，感觉自己的灵魂残缺了，甚至如果你忽略他怪异的脑袋的话，甚至感觉不出半脑人和常人有什么区别，这显然是自我意识大脑产生论者难以解释的。

以上，同样的用热力学第二定律做个小结，虽然人的大脑是非常复杂的造物，然而和人的精神世界相比还是远远不如的，如果认为人的精神世界完全是人的大脑产生的，这等于是在说，高熵的系统可以自然产生低熵的产物，这完全是无视热力学第二定律。所以，无论是从逻辑上，还是从实例上，我们都完全找不到支持大脑产生自我意识的证据。甚至，大脑产生自我意识这个命题就根本违反热力学第二定律。不客气的说，这是反科学的。

现在，我们看看第三个问题。宇宙是否起源于物质？
这个问题我们有一个很好的参考书籍，霍金的时间简史，作为一个宇宙学家，霍金的言论显然是具有相当的权威性，所以我们来看看霍金是怎么看待宇宙起源这个问题的。
在时间简史里，霍金提到了两种宇宙起源的假说，第一种是众所周知的大爆炸宇宙说，大爆炸宇宙说认为，宇宙起源于一次大爆炸，而大爆炸开始于一个点，称为奇点，那么大爆炸宇宙说是否支持唯物主义呢，很简单，这取决于奇点是否能被认为是物质，那么奇点是物质么？看看霍金是怎么描述奇点的，他在描述奇点的时候，用了三个无限，无限小的体积，无限大的密度，无限弯曲的时空。很显然，仅凭这三个无限，我们就知道，奇点不可能是物质。
必须说明的是，大爆炸宇宙说是一种被现代观测所佐证的假说，甚至可以说，大爆炸宇宙说是在观测基础上发展出来的假说，但从时间简史上来看，霍金似乎并不太喜欢这个假说，或许是如他所说的，他不喜欢一个理论里有造物主存在，而大爆炸宇宙说则给了造物主以生存空间，（比如上帝在奇点之前？）所以他在后来又提到了另一种宇宙假说，即多维宇宙说，霍金用一个虚时间的概念，引出来的多维宇宙说认为，现实世界只是高维世界的低维投影，尽管我无法理解为什么上帝不能藏在高维世界里，但很显然多维宇宙说同样不支持唯物主义，一个投影怎么可能是本源呢？现实世界甚至本身都是虚幻的，怎么可能在虚幻世界里寻求本源呢？要寻求本源就只能去高维宇宙，然而高维宇宙里有没有我们认识中的物质都不可知，又谈什么物质是本源呢？

例行的做个小结，大爆炸宇宙说显然不支持唯物论，而多维宇宙说则是把宇宙的起源推向了不可知的高维世界，不可知的高维世界是物质的么？或者说是起源于物质的么？尽管不能从逻辑上完全否认，但这种可能显然已经趋向无穷小了。
值得一提的是，多维宇宙说的出现很好的调和了热力学第二定律带来的悲观结论，我们或许可以不用担心世界终将变成废墟了，因为在多维宇宙说里，我们的现实宇宙显然不是个孤立系统，毕竟谁的投影也不能是孤立系统啊，而更有趣的是，进化论者似乎也找到了避开热力学第二定律的一线生机。现在，他们完全可以把生命的低熵归源于高维宇宙。
钟表匠原理告诉我们，如果你发现了一个钟表，你必然能得出一个结论，这个世界存在或者存在过一个钟表匠，这个原理用热力学第二定律来表达的话，那就是如果你发现了一个低熵物体，那么你必然能得出一个结论，它来自于一个更低熵的物体，所以，如果我们发现了低熵的生命，从热力学角度来说，我们只能认为，他有一个熵更低的源头，而多维宇宙说则正好提供了一个低熵的源头。唯一的问题是，这样的进化论还能成为唯物论的支柱么？

话题说到这里，我们可以继续推出一个很有趣的结论，用来回答上面的几个问题，第一，如果高维宇宙是现实宇宙的低熵来源，那么我们完全可以推出，在高维宇宙存在远比现实宇宙更为高级的生命，而这种生命是否有个物质载体呢？显然可能性是极小的，因为如前所述，高维宇宙是否是物质组成的都难以确定，又怎么可能断言有物质载体呢？所以，从这点来说，显然意识未必需要物质基础。
第二，既然意识未必需要物质基础，所谓脑死亡才是意识死亡的断言也是不成立的。我们最多只能说，脑死亡意味着意识离开了现实世界。
第三，世界只可能有两个起源，要么物质，要么精神，如果不是起源于物质，那么只能是起源于精神，只要世界起源于物质被否认了，那么世界只能是起源于精神，这是很简单的反证。

关于第一个问题，其实唯心主义是回答过脱离了肉体的意识会如何的问题，即众所周知的灵魂，但问题在于现在的人要求实证，而现在的科学没能力提供灵魂存在的实证，就我个人的看法来说，恐怕现代科学也并不愿意探讨这个问题，毕竟现代科学是在和神学的斗争中成长起来的，如果真把灵魂实证了，岂不是自掘坟墓？
然而尽管如此，我们依然可以看到哪怕在科学的体系里，灵魂依然有他存在的空间，翻开任何一本高等物理书，都会告诉你一个基本的知识，波粒二重性，这是所有的基本粒子都具有的特性，问题来了，粒子是物质很好理解，波是物质么？我并未看到哪本物理书定义波是物质，波的本质其实就是某种振动，总不能说振动是物质吧，而不是物质那就是精神，所以基本粒子可以看作是精神与物质的集合体。既然基本粒子是精神与物质的集合体，那么由基本粒子构成的世界万物，包括人类，又有什么理由不是精神和物质的集合体？更进一步的，从没人会说，基本粒子的波态需要依赖他的粒子态才能存在，那么我们又有什么理由说，由基本粒子构成的人，非要依赖肉体才能存在呢？
第二个问题，物质当然会对人产生作用，但物质对人的作用并不会触及人的本质，或者说灵魂，用一个催眠师的话来说就是，你无法靠催眠让一个道德健全的美女脱光衣服和你上床，你顶多能欺骗她说很热，然后诱导她脱衣服。药物对人的作用大约也就是做到一个催眠师的程度了。
肉体与灵魂的关系大约就如瑜伽理论里说的，肉体是灵魂的居室，或者用物理学来描述，肉体就是波函数的坍塌，灵魂则是某个波函数，波函数的坍塌才构成了这个世界，所以灵魂这个波函数也只能坍塌一下才能进入这个世界，就如我们只有开车才能上高速，但下了车并不等于我们死了。一句话，我们需要肉体才能在这个世界表达我们自己，但我们的存在本身并不依赖肉体。
第三，三个无限的问题在于，物质必须是能被度量，能被观测的东西，而加上了三个无限以后，显然就无法被观测，更谈不上度量，这样的东西，当然不可能是物质。

关于忧郁症，首先，忧郁症是个精神疾病，换句话说，肉体上并没有出现什么问题，仅就这点来说，他对唯物论者并不是个好消息，其次，据我所知，没有药物可以根治忧郁症，只能缓解，这更进一步的否认了唯物论。最后，个人见解，引起忧郁症的原因是缺爱，最好的治疗方法就是爱他。