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第一，从论文查重的计算规则来看，万方论文查重是按照连续10个字以上重复即判定为该论文部分属于重复部分，而中国知网查重不仅仅是按照连续十三个字以上重复判定为重复，而且随着中国知网的日益智能化，逐渐增加了语义识别技术，换言之，以往学生只需要对文章的部分句子进行语义调整即可躲避查重，现在若仍然采用该种论文修改方法是无法躲避知网查重的，但是仍然可以躲避万方查重，因而，从该对论文重复部分的计算和判定规则来看，万方查重显然不如中国知网查重检测系统严苛。
第二，万方查重目前数据库的覆盖范围极为有限，而中国知网查重则是在大量的资金和政策的支持下，数据库覆盖范围愈来愈广。甚至包括英文等外文数据库，中国知网论文查重系统的数据库覆盖范围是最为广泛的，这也是为什么许多同学的论文提交万方查重可能是0%的重复率，但是提交中国知网论文查重系统重复率甚至可以高达100%的原因所在。
第三，万方查重当前尚无法对代码、表格、公式等进行查重，而中国知网论文查重系统却能够对上述部分都进行查重，这也意味着中国知网论文查重系统相较于万方查重而言，对于理工科等文章的查重更为严苛。
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