肺之友吧 关注:46贴子:66
  • 1回复贴,共1

不同检测技术对于基因检测有什么影响呢?

只看楼主收藏回复

很多病友在选择基因检测项目时,除了要面对大套餐、小套餐的选择,报告时间也是家属很关心的问题,因为不管大套餐还是小套餐,动辄都是十天半个月,对于家属来说这个过程可以说十分焦急,那有没有什么检测套餐可以不用等那么久呢?
答案是有的,以PCR技术为基础的检测套餐一般报告周期为3个工作日,能够快速的交付结果。那么病友们就很自然有一个疑问,为什么不直接推荐用这个技术,一定要推荐那些时间更长的呢。事实是PCR技术实际上是差不多10年以前医院里比较流行的技术,因为当时有靶向的基因比较少,并且当时知道的突变位点也不多,而PCR技术的特点恰恰是对于已知位点可以快速准确的检测,因此在当时应用比较广泛,几乎是大型三甲医院病理科都可以自己做;但是随着对于靶向药的研究深入,EGFR基因还有些罕见位点也可以用二代药、三代药耐药需要检测C797S顺式反式、ALK基因有除了EML4基因外还有其他融合配对、HER2基因20外显子插入也有可能靶向药有效,以上等等情况,仅仅使用PCR技术是无法检测出来的,也就可能造成部分病人错失靶向机会,因此,到了现在,各大医院逐渐淘汰PCR技术,转而采用检测能力更加强大的二代测序技术,也就是所谓的大套餐、小套餐。

上面这个图就是DNA的双螺旋结构,每一个成对的AT或者CG就是一个碱基对,也就是所说的一个基因位点,基因就是有多个碱基对连接组成的。
PCR技术只能够对有限的、已知的基因位点实行检测,目前国内批准上市的大部分PCR检测试剂盒,包含的位点都是有限的,一些相对罕见的位点,甚至比如ret\met等,还没有成品化的试剂盒,也就不能进行检测,因此除了方便快捷,能检测出常见突变外,PCR技术的应用范围较窄。
当标本充足、家属急于知道结果的时候,可以考虑先做一个PCR套餐,看一下EGFR\ALK\ROS1的三联检,费用上一般在5000-7000之间;另外对于EGFR突变患者,一二代耐药后,如果经济条件有限,只想看看能否使用三代奥西,可以单独做个T790M突变,一千出头一点,但需要尽量选择数字PCR也就是ddPCR,比普通PCR准确性更高一点。
而二代测序技术,也就是NGS技术,通俗来说,则会将目标基因内的所有位点都检测一遍,因此不会漏过罕见位点,也能满足一些特殊需求,比如能够分辨三代奥西耐药后如果出现C797S突变是顺式,还是反式,从而选择不同方案。
因此,对于大部分病人家属来说,还是建议尽量选择二代测序套餐,至于选择靶向小套餐还是全基因大套餐,可以参考我前一篇帖子,谢谢。
下一篇就再来重新复习一遍为什么总说活检比血准。


IP属地:江苏1楼2020-04-13 12:11回复
    感谢老师的分享


    来自Android客户端2楼2020-04-21 14:31
    回复