中国豆豉在制作工艺上以霉菌型为主，包括根霉型豆豉、米曲霉型豆豉及毛霉型豆豉；而日本纳豆是以枯草杆菌（纳豆菌）发酵并借助较强的蛋白酶而生产出的具有独特功能性的食品。虽然中国豆豉与日本纳豆可称为孪生姊 妹，但两者在功能上还是由很大的差异性，并不能归为一类。