我们知道，一般的保健食品生产企业受生产能力和规模等因素的限制，为了最大程度利用生产线，生产过程中往往多品牌、多品种产品交替生产，共用一个车间或设备，尽管批次生产间歇也会进行清场，但对于益生菌类保健食品这种特殊的产品而言，车间、设备的混用不仅难以确保益生菌存活所需的适宜环境要求，同时也容易造成交叉感染。因此国家相关规定要求，益生菌类保健食品生产必须有专门的厂房或车间，以及专用的生产设备和设施。
而要建造符合益生菌类保健食品生产的独立厂房/车间，对企业的生产规模和技术能力无疑都是考验。看准市场潮流的果断出击，早在2012年就建成了独立的益生菌车间，该车间拥有1000平方米独立的十万级净化车间，配套20多台自动分装线设备，每天可生产益生菌120万包，还配套了多台自动盒装包装生产线，可同时满足益生菌多种包装规格的需求。车间硬件标准化高，包括进口的转轮除湿法空调系统，净化空调系统，高效的消毒灭菌设备。
面对严苛的益生菌保健食品审批，很多品牌商把目光投向了益生菌功能食品。尽管减少了在审批环节的投入，但鉴于益生菌产品的特殊性，在生产企业的选择上仍需谨慎。不仅要选择具有独立生产车间和设备的生产企业，在产品研发和人才投入上也要仔细考量。