开发商这么做是不不合理？

前提：1.本人按揭买房。2.贷款已经下发，已经按月还款超过半年。3.因为是准现房，现在开发商已经按期交房，开始装修。
向开发商索要全额发票以便办理契税，开发商这样回复：1.无法开具全额发票，因为有面积补差没有确定，如需开具发票开发商要预留5%，2.即使去房管局、税务局也办不了手续，因为开发商还没有递交申报手续。
问题：1.开全额发票需不需要交回首付款发票，不需要的话不是同样一笔钱开了两张发票么？
2.总觉得不对劲，开发商是不在交房前就应该完成面积补差的确定这些？交房后就应该直接办契税和房本了吧？
3.我现在应该怎么办？就一直等着开发商递交申报手续？拖到啥时候算啥时候？