太阳耀斑有光学耀斑和软X射线耀斑两种分类方法。
光学耀斑的级别是结合耀斑爆发时色球光学增亮的面积和亮度来确定的。按耀斑面积由小到大分为五个主要类别，分别用S、1、2、3和4表示。根据耀斑的亮度由弱到强分为三等，分别为F、N和B。例如3B表示面积在1850到3650百万平方公里之间的很明亮的耀斑。所以最大最亮的耀斑是4B，最小最暗的是SF。
太阳软X射线耀斑的强度则依据1－8埃波段太阳软X射线流量的最大值来确定，目前分为A、B、C、M和X五个级别。
一般将光学分类和X射线分类结合起来表示，能更好地反映耀斑的性质。联合表示法可表示为3B/X1.5的形式，其中X1.5表示X射线峰值通量为1.5×10-4W/m2。本周最大一次耀斑的级别为1F/C4.5。