职业生物学家确信，达尔文的变异和自然选择框架无疑是对的。正如杜布赞斯基（Theodosius Dobzhansky），20世纪一个著名的生物学家（同时也是一个虔诚的东正教基督徒）所说：“没有进化论，生物学中的一切都将无法理解。”
上个世纪除道金斯之外，最广为人知的进化论代言人斯蒂芬.杰.古尔德，在一篇书评中，严斥道金斯的观点：
我代表我的同事们并且是无数次地重申：科学决不能凭借其自身特有的方式来裁定上主有可能通过超自然方式干预自然的争论。作为科学家，我们既不能证实也不能否证上主的存在。如果我们中有人宣称达尔文主义否定了上主的话，那么我会找来麦金纳尼（McInerney）女士（古尔德三年级的老师）来敲肿那些人的手指......科学的运作仅通过自然主义的解释；它既不能断定也不能否定，在其他领域（比如说道德领域）存在着其他类型的行动者（比如说上主）。暂且不提哲学，近百年来的简单事实就足以说明这个问题。达尔文本人就是一个不可知论者（在他最疼爱的女儿凄惨地离开人世之后，他就丧失了宗教信仰）。但伟大的美国植物学家阿沙.格雷（Asa Gray），他钟爱自然选择理论，并写了一本名为《关于达尔文主义》（Darwiniana）的书，就是一位虔诚的基督徒。时间往后挪50年，查尔斯.D.沃尔科(Charles D.Walcott),伯吉斯页岩化石群（Burgess Shale Fossils）的发现者，一位忠实的达尔文主义者，同时也是一位坚定的基督徒，他相信正是上主安排自然选择的方式，并依据他所制订的计划和目的来构建生命历史。时间再往后推50年，我们这个时代两位最杰出的进化论者G.G.辛普森（G.G.Simpson）和杜布赞斯基，前者是一位人本主义的不可知论者，后者是一名俄罗斯东正教基督徒。以上事实表明，要么就是我为数不少的同事极其愚笨（指他们有宗教信仰——译者注），要么就是达尔文主义的科学可以与传统的宗教信仰和谐共存。
所以那些无神论者必须为他们的立场寻找到其他合适的基础，但进化论却不适于此。
随着对我们自己以及地球上其他物种基因组研究的成果迅速积累，关于后代如何由一个共同的祖先通过变异而生成，我们已有一种极为丰富且详细的观点。这种所有生命体具有相关性的优美证据不但不会令人不安，反而令人肃然起敬，此证据是全能上主的高明计划，祂不仅创造了宇宙，而且还将物理参数调整得恰到好处，以保证恒星、行星、重元素以及生命自身得以形成。这一观点的合适称谓就是“有神论的进化”（Theistic Evolution）。
有神论的进化在严肃的生物学家、同时也是严肃的信徒心目中的地位是举足轻重的。这些人中有阿沙.格雷——达尔文在美国的主要拥护者，还有杜布赞斯基——20世纪进化思想的建筑师。许多基督徒，包括已故教宗若望.保禄第二也都持有这样的观点。
不受空间和时间限制的上主，创造了宇宙，并且还创立了控制宇宙的自然规律。为了使荒凉的宇宙充满生命，上主还选择进化这一奇妙的机制来创造各种各样的微生物、植物、动物。最值得关注的是，上主有意选择同一机制来形成特殊的生物，它们拥有智能及分辨是非的知识、还有自由意志以及寻找与上主建立关系的愿望。
教宗若望.保禄第二在1996年给教宗科学院（the Pontifical Academy of Sciences）的信件中指出，尤其要深刻且大胆地捍卫有神论的进化观。他承认进化是一种生物学事实，但又注意与灵性的层面保持平衡，以此回应他的前任庇护第十二的观点：“如果人类躯体起源于先前已经存在的生命物质，那么精神层面的灵魂就是直接由上主所创造。”
如果上主存在于自然界之外，那么祂也就存在于时空之外。在这种情况下，上主在创造宇宙的同时也就知道了未来的每一细节，包括恒星、行星、星系的形成，还有导致地球上生命得以产生及其人类进化的全部化学、物理学、地质学和生物学......在此情况下，进化在我们看来是由偶然性所驱使，而在上主看来，其结果则完全可以确定。因而，上主能够完全并且内在地涉入所有物种的创造过程之中，然而人类却由于受线性时间的限制，认为进化就是一个随机和无方向的过程。
上个世纪除道金斯之外，最广为人知的进化论代言人斯蒂芬.杰.古尔德，在一篇书评中，严斥道金斯的观点：
我代表我的同事们并且是无数次地重申：科学决不能凭借其自身特有的方式来裁定上主有可能通过超自然方式干预自然的争论。作为科学家，我们既不能证实也不能否证上主的存在。如果我们中有人宣称达尔文主义否定了上主的话，那么我会找来麦金纳尼（McInerney）女士（古尔德三年级的老师）来敲肿那些人的手指......科学的运作仅通过自然主义的解释；它既不能断定也不能否定，在其他领域（比如说道德领域）存在着其他类型的行动者（比如说上主）。暂且不提哲学，近百年来的简单事实就足以说明这个问题。达尔文本人就是一个不可知论者（在他最疼爱的女儿凄惨地离开人世之后，他就丧失了宗教信仰）。但伟大的美国植物学家阿沙.格雷（Asa Gray），他钟爱自然选择理论，并写了一本名为《关于达尔文主义》（Darwiniana）的书，就是一位虔诚的基督徒。时间往后挪50年，查尔斯.D.沃尔科(Charles D.Walcott),伯吉斯页岩化石群（Burgess Shale Fossils）的发现者，一位忠实的达尔文主义者，同时也是一位坚定的基督徒，他相信正是上主安排自然选择的方式，并依据他所制订的计划和目的来构建生命历史。时间再往后推50年，我们这个时代两位最杰出的进化论者G.G.辛普森（G.G.Simpson）和杜布赞斯基，前者是一位人本主义的不可知论者，后者是一名俄罗斯东正教基督徒。以上事实表明，要么就是我为数不少的同事极其愚笨（指他们有宗教信仰——译者注），要么就是达尔文主义的科学可以与传统的宗教信仰和谐共存。
所以那些无神论者必须为他们的立场寻找到其他合适的基础，但进化论却不适于此。
随着对我们自己以及地球上其他物种基因组研究的成果迅速积累，关于后代如何由一个共同的祖先通过变异而生成，我们已有一种极为丰富且详细的观点。这种所有生命体具有相关性的优美证据不但不会令人不安，反而令人肃然起敬，此证据是全能上主的高明计划，祂不仅创造了宇宙，而且还将物理参数调整得恰到好处，以保证恒星、行星、重元素以及生命自身得以形成。这一观点的合适称谓就是“有神论的进化”（Theistic Evolution）。
有神论的进化在严肃的生物学家、同时也是严肃的信徒心目中的地位是举足轻重的。这些人中有阿沙.格雷——达尔文在美国的主要拥护者，还有杜布赞斯基——20世纪进化思想的建筑师。许多基督徒，包括已故教宗若望.保禄第二也都持有这样的观点。
不受空间和时间限制的上主，创造了宇宙，并且还创立了控制宇宙的自然规律。为了使荒凉的宇宙充满生命，上主还选择进化这一奇妙的机制来创造各种各样的微生物、植物、动物。最值得关注的是，上主有意选择同一机制来形成特殊的生物，它们拥有智能及分辨是非的知识、还有自由意志以及寻找与上主建立关系的愿望。
教宗若望.保禄第二在1996年给教宗科学院（the Pontifical Academy of Sciences）的信件中指出，尤其要深刻且大胆地捍卫有神论的进化观。他承认进化是一种生物学事实，但又注意与灵性的层面保持平衡，以此回应他的前任庇护第十二的观点：“如果人类躯体起源于先前已经存在的生命物质，那么精神层面的灵魂就是直接由上主所创造。”
如果上主存在于自然界之外，那么祂也就存在于时空之外。在这种情况下，上主在创造宇宙的同时也就知道了未来的每一细节，包括恒星、行星、星系的形成，还有导致地球上生命得以产生及其人类进化的全部化学、物理学、地质学和生物学......在此情况下，进化在我们看来是由偶然性所驱使，而在上主看来，其结果则完全可以确定。因而，上主能够完全并且内在地涉入所有物种的创造过程之中，然而人类却由于受线性时间的限制，认为进化就是一个随机和无方向的过程。
