首先说一下游戏的主线剧情，基本和拳皇里的剧情一致，草薙京同伙伴人等参加比武大会夺冠，父亲的道馆被摧毁，以为父亲被人抓走，开始寻找父亲的下落，遇到其他伙伴和各种事情，后来才知道他父亲去旅游了，气个半死，为了把父亲抓回来开始了各种寻找，途中碰到的各种事情以及最后的三神器封印大蛇。