肠道粘膜中存在着人体最大的免疫细胞群体，与多种疾病息息相关。肠道明明是消化器官，为什么又要是免疫器官呢？肠道的天赋使命是消化吸收，它的设计首先考虑如何高效率的执行消化和吸收。小肠内部有无数的绒毛，每根绒毛上又有无数的微绒毛，总表面积达到300平方公尺，远大于皮肤（2平方公尺）及肺部黏膜系统（80平方公尺）的表面积。
肠道表面覆盖着由单层上皮细胞构成的黏膜，黏膜下面就是密密麻麻的微血管及乳糜管系统。食物由口腔、胃到小肠，在精密调控下，消化分解成胺基酸、葡萄糖、脂肪酸等小分子，通过黏膜被吸收，然后，由微血管、乳糜管等迅速进入循环系统。这就是肠道为了有效执行消化吸收而做的设计，惊人的大面积，高效率的黏膜吸收，高效率的物质运输。
现在问题浮现了，别忘了肠道同时也是最危险、最肮脏的地方，无数由口腔侵入的病菌，毒物，以及肠道原本就存在的坏菌军团，虎视眈眈的想伺机入侵人体。好的、有益的营养素能够高效率的被吸收，被输送到全身；同样的，坏的、有害的毒素、病菌，也可能同样的被高效率吸收、高效率的输送。
各位朋友，我们的身体在设计防卫体系时，将大部份的免疫军队，配置在肠道，用来保护肠道黏膜的安全。
有七成以上的免疫细胞（如巨噬细胞、T细胞、NK细胞、B细胞等），集中在肠道；有七成以上的免疫球蛋白A，由肠道制造，而且用来保护肠道。所以，说肠道名符其实是最重要的免疫器官。
如果肠道不好，敌军（坏菌）大举入侵，同盟军团（好菌）节节败退，战争延烧到肠道黏膜，你的免疫细胞前仆后继，尸横遍野。你想想看，你的免疫系统怎么可能好呢？所以，肠道名符其实是免疫最前线。
人体的第一道免疫防线是皮肤和黏膜。皮肤覆盖在身体，除了气体，水分，以及像精油等少数小分子物质外，除非有伤口，否则病菌毒物不易入侵。但是像肠道，肺泡，肾丝球等，身体里面需要高效率交换物质的地方，就必须以黏膜系统覆盖。
第二道免疫防线称作先天性免疫。这个系统不需经过教育训练，就可以立刻对外来的感染作出反应，只能分辨敌我，但却无法对特定的敌人作出选择性反应。中性粒细胞，巨噬细胞，NK细胞是先天性免疫系统的三员大将。
