说实话，会影响。如果是交学校前最后一次查重，建议排版好再查，确保和提交学校的版本是一致的。
当然这里的格式不是指字体、颜色、行间距等等，而主要是三点：
首先，目录要自动生成，参考文献格式正确，才不会被标红；
其次，各章节标题是否为标题格式，会改变系统分段，有时对结果影响很大，有同学自己查重合格，重新排版后交到学校查，重复率升高了10%；
最后，关于word和pdf查重，一定要按学校要求来，因为结果可能差异很大，如果两个都允许，首选用word查。因为pdf会查页眉页脚（脚注），参考文献标红几率大，以及可能出现各种各样的问题。
