现代科学认为，蛇起源于蜥蜴，但这是不对的。蛇属于源生物种，应单独列为一类，有以下几种原因：
（1）蛇的嘴可以张的很大，同时下颚骨可以向前舒张，吞下很大的猎物，5800万年前的生活在南美洲的泰坦巨蟒(tianoboacerrejonesis)甚至将鼻鳄（crocodilyform长4.57米，重达半吨）作为主要食物，但是蜥蜴类物种无法办到，泥盆纪的邓氏鱼也有下颚骨向前舒张的能力，也就是说，蛇类起源更早。
（2）蛇类生物为何进化成没有四肢的生物呢？同样是泰坦巨蟒(tianoboacerrejonesis)，这种蛇类可以长到15米左右，已经超过了生物自重体的极限（胖到走不动路了），但是泰坦巨蟒(tianoboacerrejonesis)可以靠浮力生存，同样是蜥蜴类生物无法办到的。