呃，算是终极解释吧

男主倒数第二次穿越后（就是凯丽被误炸那个），发现自己躺在精神病院的病床上。
无论是稍早之前他自己的回忆倒放、还是医生的回答，都说明，他是7岁就被送进来了。医生还说，大学、日记，都是男主因为对凯丽之死的愧疚而产生的幻觉，就像爸爸的相册一样。
凯丽死过2次，1次是大学的男主回来找她谈人生之后自杀；1次就是男主穿越回去后被误伤。
OK，问题来了：假设最后那医生所说为真，7岁以后皆为幻觉----那么，7岁的男主是如何准确知道那个炸药就放在那个保温杯里、走过去就攥手上了呢？要知道汤米翻箱倒柜找炸药可是男主13岁时候的事情哦~按医生的说法和男主自己的回忆，13岁的他应该乖乖待在精神病院里呀！
所以，个人以为，医生最后的这一番话，极为关键，逻辑上反证了影片的主旨（或者说导演想说的话）---男主不是精神病，他就是穿越了。相对应的，他爸爸和爷爷也是如此。
既然是穿越，那么整个电影就都不是幻觉。故事也比较好梳理了。
男主就是妈妈的第三胎，偶然发现自己具备了穿越过去改变未来的能力。可惜几经辗转后发觉自己不出生才是对深爱的妈妈、凯丽以及其他人最佳的选择，所以就弄死了自己。妈妈在产床上喊出的not again，也证明他至少不是第一个死胎。
影片结尾，不仅其他人个个花团锦簇，妈妈最后也再婚了，跟个黑头发的老公生了个金头发的孩子（。。。）。
曾经有点惋惜，为啥影片不能安排男主像第一次穿越那样，口绽莲花阻止了变态大叔，然后人见人爱花见花开，妈妈也很自豪，非得让他还要杀人坐牢。后来想想，这才是影片的精髓之处。绝不是烧脑，而是在展现了一大圈人间的悲欢离合之后，又回到了那个永恒的主题---爱。为了爱，为了对妈妈和凯丽的爱，宁愿放弃自己那不曾拥有的生命。
可以猜测，爷爷和爸爸也是如此抉择的。只不过他们的最佳方案似乎是死在精神病院。在他们不断穿越的时候，应该也看见过男主好几个版本的结局吧？如此说来，爸爸在精神病院要掐死男主也是做戏，他应该清楚知道这对孩子以及他未来的变化的影响。
三代男人最后都选择了死，这就是，爱的代价。
其他一些细节，例如为什么有的穿越不改变未来、有的穿越流鼻血有的不流，爸爸的相册等等，网上大多有比较合理的解释了，也可以自己去探索。
有点疑惑的是男主最后一次穿越前写下的字条，说如果计划失败自己就（已经）死了。失败了不就是抓回精神病院继续打针吃药呗，怎么会死呢？

你这个点找的很好，如果不是导演失误，那就是可以这么想，毕竟是开放式的

应该不是失误，导演的重点不是平行宇宙与幻觉之争。他不想对穿越本身搞暧昧。通过医生之口，他摆明车马告诉观众确实是穿越。他的重点是在蝴蝶效应--你穿越了不动别人，你就可以回到这一版本的生活，可能身上多个疤、甚至毫无变化；你动了别人，就是天翻地覆；见血死了人了，就流鼻血，没有就不流，等等。
这片子跟《彗星来的那一夜》《穆赫兰道》和《恐怖游轮》还是不同的，这三个都是逻辑上都是开放的，幻梦、记忆交错、穿越上身都说得通。
另外，从医生这个细节来说，穿越要比幻觉更有逻辑合理性。也许会有人说把逻辑建立在虚幻的穿越上本身就不合理。对此，我觉得，精神分裂症和穿越其实是一回事，都是人类对自己认识（所谓的科学）所无法解释的部分给安上的一个名字。区别无非是前者披着个貌似科学的马甲、后者被扣着一顶封建迷信的帽子而已。