目前，医学界普遍认为ASD的病因除了受遗传因素和环境因素外，还涉及食物不耐受，胃肠道问题，营养缺乏，免疫代谢问题等。
这些问题都造成机体营养物质的摄入不足，导致大脑的饥饿，最终有可能成为触发自闭症发病的扳机，造成ASD的发病。
由于ASD儿童普遍存在饮食问题，致使食物摄入物的多样性降低，导致营养素摄入明显不足，加之食物不耐受导致的以及患者本身存在的一些胃肠道问题如胃食管反流、胃肠道炎症肠渗透性改变、肠菌失调等导致食欲不振，及消化不良多种症状，从而影响食物的消化和营养物质的吸收，进一步导致营养物质的缺乏，进而造成大脑营养不足。
肠道菌群中的一些有益菌不仅可以从食物中吸收营养物质，还会积极地合成各种各样的营养物质如维生素、各种氨基酸和其他一些活性物质。因为很多维生素和其他一些活性物质在体内存留时间非常短暂，所以除非一个人每隔一小时摄入这些维生素，否则一天之内人体都会存在缺乏维生素的时间段，如果肠道菌群失衡，我们无法不断地供给身体所需的固定流量的维生素和其他一些活性物质，所以建议每一位心理综合征儿童和成人显现出缺乏这些原本肠道菌群应该产出的维生素，在他们的肠道内恢复有益菌是处理这些营养缺乏的最佳方式。