一、臭氧杀菌机理
臭氧通过放电原理产生，有强烈的氧化能力，能迅速地与细胞壁、细胞膜、脂质结合反应，破坏分解细胞，起到杀菌作用。臭氧比氧重1.5倍，能增加水中溶氧值（速率大于氧气向水中的溶解）和调节水中的PH值，特别是与紫外线组合使用，可较大幅度地减低BOD、COD，降解氨氮，改善养殖水质。杀菌效率优于氯气和次氯酸钠。在工厂化养鱼的运用中根据具体养殖对象和水质条件确定其投加量。其残余臭氧的泄露问题通过重复循环、活性炭吸附和加热方法解决。
制氧机，产生的氧气（富氧:富级的分子态氧气，氧含量90% 左右），由分子筛或膜分离获得，其用途是为臭氧发生器提供气源，增加臭氧产量（空气中氧的利用率是21% ），除此之外另一应用优点是可促进鱼体生长，还有灭菌、抑菌作用。
二、臭氧的作用
1.杀菌消毒；臭氧不但可以杀灭各种细菌，而且对紫外线不能杀灭的寄生虫、寄生虫卵、真菌及真菌孢子体等具有很强的杀伤力；
2.分解氨氮；一个臭氧与一个氨氮结合生成二氧化碳和水。
3.除色、去味；通常臭氧的强氧化作用，很快使水质变得清澈和清新。