院校专业组平行志愿投档是以院校专业组为投档单位，按考生投档分从高分到低分排序，依次检索考生所填院校专业组志愿，符合投档条件的即向该院校专业组投档，如没有符合投档条件的则不能投档。上述过程完成后，无论档案是否投出，均视为该考生已享受了本次平行志愿投档机会。
如果考生档案投档到某院校专业组后，因故被退出，将不再补投到该次考生所填报的其它院校专业组志愿。