此次新作故事将转战中亚国家塔吉克斯坦，那个阿富汗附近的常年征战的不稳定地区，曾经苏联有一借其为跳板来扩张实力，试图像同抑制中国。从这点来看，在故事剧情上与2代将无太大连贯。
《闪点行动3：红河》将会让玩家东西横跨整个塔吉克斯坦，体验[1]长达200公里的水路作战历程，那将会是一个充满了沙尘和酷热的“死亡环境”。
敌人AI的部份设定的相当聪明，甚至能以令人愤怒来形容，因为他们不仅会逃跑，也会用声东击西的战术来攻击玩家的二翼，造成玩家在措手不及的情况下就被杀死。此外，诱饵战术也是敌人很常见的进攻方式之一，若玩家在搞不清楚的状况下为了杀死诱饵而曝露位置，此时只会被敌人打假的而已。因此玩家在任务点附近巡逻时，若听到侦察兵标示出敌人的位置后，最好别掉以轻心，他们很有可能是诱饵。
这次《闪点行动3：红河》增加了武器熟练系统，每个兵种各有独立的经验值计算方式，使用枪械杀的敌人愈多，角色对该枪械的熟练度也愈高，并能增加射击时的准确率。此外，玩家也能自订武器的附加套件，例如：狙击镜的倍数、步枪的灭音器等套件，当然，玩家也必须随着任务的内容选用不同的附加套件。
任务的内容与前作差不多，不过让玩家能呼叫空袭的机会变多了不少，只要玩家能安全地抵达空袭的观察点后，便能呼叫战机或大炮进行大规模轰炸。玩家在游戏中也有机会搭乘/操控多种现实生活中的悍马车、直升机等军用载具。