抑郁症作为最常见的精神已影响了全球超过 3 亿人。由于病征类型多样，抑郁症的病理学成因至今仍没有定论。了解抑郁症的发病机制对于制定有效的治疗方案至关重要。有实验通过抑郁症动物模型研究发现， 肠道菌群的改变可能是导致抑郁症的因素之一。

共生微生物对宿主的影响受到越来越多的关注。其中，肠道微生物的影响被发现涉及多种生理过程，包括免疫、代谢和中枢神经系统调节。“肠 - 脑轴” 是中枢神经系统和消化系统之间双向动态沟通的多种途径的总称。作为肠 - 脑轴的重要组成部分，肠道菌群能通过多种方式影响神经系统 。

肠道菌群能产生具有神经活性的代谢物质，如去甲肾上腺素、多巴胺等神经递质，以及短链脂肪酸等微生物代谢产物，从而直接或间接地影响神经系统。肠道菌群对于外周炎症反应的调节，也会对大脑活动产生影响。肠道菌群也被发现与多种神经系统疾病有关。 肠道菌群能够通过调节化学信号分子和免疫系统参与自闭症的病理机制；通过免疫、代谢和神经通路，调节阿兹海默症、帕金森病等神经退行性疾病的发病风险和病理表型。
研究发现了抑郁症的几种生理机制，包括应激反应不良导致的 HPA 轴调节异常、炎症反应、神经可塑性下降和神经递质系统扰动。海马（hippocampus）的变化是抑郁症生理机制的重要组成部分。海马体积缩小是抑郁症的临床标志之一。研究中常常将海马神经发生减少作为抑郁症的神经生理指标。
在抑郁和焦虑患者中，肠道菌群的组成会发生特征性的变化，益生菌干预疗法还被证明能够改善动物的抑郁样行为和抑郁症患者的情绪。肠道菌群的失调会导致一些菌群代谢产物的缺失，进而影响大脑的神经递质系统，促使抑郁症状出现。
因此，在这种情况下，对症下药地进行饮食干预、补充益生菌，菌群移植疗法等有希望成为有效治疗情绪障碍的新方案。在日常生活中，我们也应该保持良好的饮食、生活习惯，适当地补充肠道益生菌。维持健康的肠道菌群，才能保证大脑的正常功能，将抑郁等情绪障碍防于未然。