尽管人们从生物学角度审视自闭症为不可治愈的疾病，但自闭症患儿有可能通过早期干预治疗恢复正常，因此自闭症是可以治疗的。
目前自闭症治疗没有有效药物，但粪菌移植却起到了很明显治疗作用，自闭症患儿往往伴有便秘，消化道功能紊乱，在接受粪菌移植后患儿症状有明显改善，这种改善随着治疗停止也会有反复，据报道粪菌移植的疗效能维持四个月左右，有些甚至很快复发，虽然疗效不能持续，但说明孩子大脑有开发潜力，通过一种激发机制有可能让孩子恢复正常。
颈动脉外膜剥脱术是将颈动脉外膜交感神经网络剥脱，使颈动脉扩张，血流增加，脑血流增加后患儿症状也会有明显改善，这也说明患儿大脑存在改善症状的潜力。
虽然以上两种方法有短暂疗效，但对患儿来说有重要意义，可以通过治疗加强康复训练的效果，有积极治疗意义。
核医学治疗是利用核医学方法对患儿大脑进行刺激，激活潜在休眠或功能低下的脑细胞，改善局部脑血流，消除脑内炎症，抗氧化应急，提高过氧化物歧化酶活性，减少氧化自由基以降低自由基对脑血管和脑细胞的损坏，减少免疫复合物沉积，刺激大脑发育而起到治疗作用，而且能明显改善患儿症状，与肠菌移植和颈动脉外膜剥脱术不同，这种作用持续稳定。
我们做过多例患者，先进行核医学治疗，后进行颈动脉外膜剥脱术，患儿症状又会有飞跃性改善，如果再加上粪菌移植，预计疗效更加明显，这为患儿康复干预打下良好基础。
单纯治疗自闭症核心症状改善后必须对患儿进行强化康复训练，行为干预非常重要，治疗很难改变一个人的习惯，行为干预能纠正行为异常。