高温处理不会影响转基因大豆油的鉴别。虽然高温加工会影响大豆油中的营养成分和味道，但并不会改变转基因大豆油中的转基因成分，因此这些成分仍然可以通过PCR等方法进行鉴别。但需要注意的是，大豆油可能会被掺假或混合，这会影响鉴别的准确性。因此，必须采取科学有效的方法，结合多种手段综合鉴别，才能真正判断大豆油是否为转基因产品。