省、自治区、直辖市的发展和改革委员会是负责农村风貌改造的部门。这些部门会负责制定改造的规划方案，组织开展总体规划，抓好投资实施、常态化管理和监督管理工作，确保改造工作按计划顺利实施，圆满完成农村风貌改造任务。另外，政府可以采取多部门协同的方式，将农村风貌改造任务纳入城乡建设规划，由国土资源部门、城市管理部门、生态环保部门等多部门负责分工，跨部门协作实施改造工作。