应当单独计税。因为不同的品种或业务有其特定的税制规定，例如有的特定的商品和服务可以享受减税政策，可以对其单独计税来避免不必要的税收负担。此外，单独计税使税务主管部门能够更清楚的把握每项税负，也可以保证每项税款的准确性和及时性。税收综合由企业根据不同的情况适用，综合计算具体税款，如增值税综合计算，可以大大减少时间成本和会计成本，而且加强监管效果，减少逃税行为。