马自达3的主要缺点是，车身和内部空间较小，4个座位只能容纳5个成人。动力不够，发动机最大功率仅为2.8千瓦，爬坡能力较差。电子设备较老旧，车载显示屏的分辨率很低，音响效果也不好，用于连接智能手机的配套功能也较弱。驾驶习惯性安全配置较低，主要有ABS及胎压监测系统，但辅助驾驶功能较弱，没有自动刹车功能。此外，马自达3在基本技术和性能上都处于下游，它的安全性和舒适性都有待提高，油耗也略高，最高油耗为6.9L/100km。另外，它的外观也不尽人意，虽然采用了双气囊等安全配置，但也未能完全拉近与欧美同级车的差距。从上述情况来看，马自达3的缺点还是比较明显的，它在技术、舒适性、安全性和外观上均有待提升，以满足消费者对于汽车性能方面的需求。