目前临床上治疗原发性血小板增多症的一线方案主要是羟基脲、干扰素（可分为短效、长效）治疗等，阿那格雷则属于二线治疗药物，一般在羟基脲、干扰素治疗失败的情况才会考虑阿那格雷。但近几年，由于原发性血小板增多症病程进展较慢，因此多需要长期治疗甚至是终身治疗，不少患者由此比较担心副作用的影响，所以更倾向于安全性较高的阿那格雷。
在此需要说明的是，在一线治疗方案仍然见效的情况下，不建议患者直接更换为二线治疗方案。虽然阿那格雷的安全性较高，但长期服用，其副作用仍然无法完全规，例如长期使用阿那格雷就有缩短患者生存时间以及诱发继发性骨髓纤维化提前发生的可能。且阿那格雷的费用较高，对于经济压力较大的患者来说，并非是一个很好的选择。

如果一线治疗方案已经治疗失败，则积极寻找失败原因，选择阿那格雷治疗时，可考虑联合治疗增效减毒，提高患者的生存几率，延长其生存时间，降低副作用影响，提高患者的生活质量。
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