摩托车报废办理流程如下：1、车主携带身份证、行驶证和机动车登记证书到当地车管所填写《机动车注销申请表》；2、车管所会对车辆进行查验，车主提供车辆资料即可；3、车管所会将车主的车辆资料上传到系统；4、车辆审核通过后，车管所会通知车主领取号牌和行驶证。