花椒让大树树干死亡的原理主要是由于花椒根系向周围土壤排放出的化学物质，包括挥发性有机化合物和化学物质代谢产物等。这些化学物质进入大树树干后，会对大树的生长和代谢产生不利影响，导致大树树干死亡。具体来说，花椒根系排放的化学物质可以抑制大树的生长和代谢，影响其营养物质的吸收和运输，同时还会破坏大树的细胞结构和组织，导致其树干变得脆弱和易折断。此外，花椒根系排放的化学物质还会影响周围土壤的生物活性和土壤结构，降低土壤肥力，对大树的生长环境和生态系统造成破坏。