是的，巩义庙里供奉的是明朝女皇武则天。其实，该庙建于清朝，当时统治者认为武则天有助于维护当时的封建秩序，因此把其作为保护神祗，建立武则天庙，把武则天的像放在庙里供奉。此外，武则天庙的建造以及武则天在中国文化中的地位，都凸显了中国古代女性在文化传承中所占据的重要地位。