不会合并，因为转专业的学生要换宿舍是因为改变了学院，新的学院有可能不同以前的学院设有相同的宿舍，这样就不方便把学生合并。此外，新的学院也有可能开设其他的课程，把转专业的学生和之前的学生合并可能会影响到课程的安排，甚至考试安排等，所以一般情况下，转专业学生在换宿舍后不会合并。