肇东第二中学的高光时刻有很多，其中最为突出的是学校多次在省、市各类教育考试中取得优异成绩。例如在2020年的全省高中数学联赛中，该校三位学生获得省级一等奖；在全国初中信息学奥赛中，学生荣获全国特等奖。此外，该校艺术教育也取得了不少突破，校团委牵头的“青春梦想 杏林情”活动获得市文明校园推荐活动；音乐组织的“我们的节日·十九大”晚会受到广大师生好评等等。这些高光时刻的背后，是肇东第二中学秉持办学理念和学科发展、教学改革等方面的不断注重与创新。